העימותים בין כוחות הביטחון הפלסטיניים לפעילי טרור במחנה הפליטים ג'נין נמשכים זה היום החמישי. במבצע משתתפים המשטרה הפלסטינית, הביטחון המסכל הפלסטיני ושירות המודיעין הכללי.
החיכוכים עם פעילי הטרור המקומיים הולכים ומסלימים לאחר שאנשי המנגנונים הרגו את ראהבי שלבי בן ה-19 ופצעו את קרוב משפחתו בן ה-16 שכפי הנראה לא היו חמושים. חמאס הוציא הודעת גינוי על הריגתו של שלבי, שלא ידוע אם השתייך לחמאס או לא.
אנשי המנגנונים חיסלו במהלך המבצע גם את יזיד ג'עיסה, מפקד "גדוד ג'נין" שהיה מבוקש ברשות ובישראל. פעילי הגדוד מזוהים עם הג'יהאד האסלאמי, אבל לא משתייכים רשמית לאף ארגון. בשנים האחרונות, וביתר שאת מאז תחילת המלחמה, פעילי טרור רבים נמנעים מהשתייכות ארגונית, ומזדהים רק בשם המקום שבו הם פועלים. קבוצת-הגג המכונה "גדוד ג'נין" כוללת פעילים מגדודי חללי אל-אקצא של הפת"ח, גדודי אל-קודס של הג'יהאד האיסלאמי וגדודי עז א-דין אלקסאם של חמאס.
המצב במחנה הפליטים ג'נין הסלים בימים האחרונים, בעיקר לאחר מותו של ג'עיסה בחילופי אש עם אנשי מנגנון הביטחון שביצעו מעצרים בשבת בבוקר. באתר החדשות "אל-קודס", דווח כי מאז מותו של ג'עיסה נעשים ניסיונות לגשר בין ארגוני הטרור למנגנונים, שמעוניינים ב"תמונת ניצחון" על ארגוני הטרור בג'נין, אך אלה לא צלחו.
גם קואליציית קבוצות ההתנגדות העממית (PRC) גינתה את הריגתו של ג'עיסה וכינתה זאת "הפרה חמורה של כל הנורמות והמסורות הלאומיות, בהתאם לאג'נדה הציונית שמטרתה לחסל את ההתנגדות בגדה המערבית".
צה"ל פעל עד לפני כחודש במספר הזדמנויות בג'נין, במסגרת מבצע "מחנות קיץ", שבו חוסלו 14 מחבלים, בהם ראש התארגנות חמאס בעיר. בחודש האחרון נמנע צה"ל מפעילות, כפי הנראה במטרה לאפשר למנגנוני הביטחון הפלסטיניים לנסות בעצמם לצמצם את היקפי הטרור בעיר, ולהציג את יכולותיהם כשברקע הדיון על מסוגלותה של הרשות הפלסטינית למשול ברצועת עזה.
זו לא הפעם הראשונה שגדודי חללי אל-אקצא של הפת"ח נמצאים בעימותים אלימים עם כוחות הביטחון של הרשות הפלסטינית, שנשלטת בעצמה על ידי פת"ח. בשנתיים האחרונות דווח כי קיים נתק הולך וגובר בין הצדדים, וכי חללי אל-אקצא כבר לא נתמכים על ידי הפת"ח.
בתחילת החודש הרשות הפלסטינית עצרה מספר פעילי טרור, ודובר הרשות הפלסטינית, אנואר רג'ב, אמר שהמבצע הנוכחי בשם "הגנה על המולדת", יצא לדרך כדי "למגר המרדה וכאוס" ברשות הפלסטינית.
בצה"ל סירבו להגיב על נושא התיאום הביטחוני עם הרשות הפלסטינית בנוגע למבצע בג'נין.