שירי ביבס נרצחה בסמוך למועד בו נרצחו ילדיה אריאל וכפיר. המידע המודיעיני המוצק שהועבר לשב"כ ולאמ"ן, וכן בדיקות שבוצעו במכון לרפואה משפטית באבו כביר, הביאו לקביעה כי מעשי הרצח בוצעו במהלך חודש נובמבר 2023.
במערכת הביטחון אומרים כי חוטפי ורוצחי משפחת ביבס נמצאים בראש רשימת המשימות של יחידת ניל"י (נצח ישראל לא ישקר) שהוקמה בשב"כ ותפקידה לאתר ולבוא בחשבון מול כל מחבלי החמאס והג'האד האיסלאמי שהשתתפו במעשי הטבח בעוטף ב-7 באוקטובר ובמעשי הרצח של החטופים.
קיבוץ ניר עוז הודיע הלילה (בין שישי לשבת) על הירצחה בשבי עזה. "קיבוץ ניר עוז מודיע בכאב ובצער עמוק על הירצחה של שירי ביבס ז"ל, אשר נחטפה מביתה בשבעה באוקטובר ונרצחה בשבי בעזה", נכתב בהודעה. "שירי, שנחטפה כשהייתה בת 32, נולדה וגדלה בניר עוז. במשך שנים טיפלה במסירות בילדי הקיבוץ כחלק ממערכת החינוך, והייתה אהובה על כל מי שהכיר אותה".
משפחת ביבס מסרה: "הלילה שירי שלנו הושבה הביתה. לאחר הליך הזיהוי במכון לרפואה משפטית, קיבלנו הבוקר את הבשורה ממנה חששנו, שירי שלנו נרצחה בשבי וכעת שבה הביתה אל בניה, בעלה, אחותה וכל משפחתה למנוחה. על אף החשש לגורלם המשכנו לקוות שנזכה לחבק אותם וכעת אנו כואבים ושבורים. 16 חודשים ביקשנו וודאות וכעת אין בה נחמה, אך מקווים לתחילתה של סגירת מעגל. שירי היתה אם מופלאה לאריאל וכפיר, בת זוג אוהבת לירדן, אחות ודודה מסורה וחברה מדהימה. בשעה קשה זו אנו ממשיכים לדרוש ולקרוא להחזרתם המיידית של יתר החטופים שעוד בשבי. אין מטרה חשובה מזו. לא יהיה שיקום בלעדיהם". יפעת, בת דודה של שירי ביבס ז"ל כתבה: "עכשיו אתם בבית, סליחה שלא הצלחתי, לא הגיע לכם".
בשבעה באוקטובר 2023 נחטפה משפחת ביבס מביתה בקיבוץ ניר עוז. ירדן ביבס, קיבוצניק שנולד וגדל בצאלים ובהמשך הקים את משפחתו בניר עוז, נלקח בנפרד מאשתו שירי ושני בניהם הקטנים – אריאל וכפיר. ירדן שוחרר במסגרת הפעימה הרביעית של עסקת החטופים השנייה ב-1.2.2025. בקשתו הראשונה של ירדן – להשיב את משפחתו: "האור שלי עדיין שם וכל עוד הם שם, פה הכל חשוך. בזכותכם החזירו אותי, תעזרו לי להחזיר את האור לחיי".
שירי נתפסה בעת החטיפה כשהיא אוחזת בכל כוחה בשני ילדיה העטופים בשמיכות. בתיעוד שהגיע מאתרים פלסטינים, נראה אריאל עם מוצץ בפיו. באותו בוקר טרגי איבדה את הוריה, יוסי ומרגיט סילברמן, שנרצחו בידי המחבלים.
