משתתפי המשט מדלין לעזה טענו הלילה (בין ראשון לשני) כי ספינות ישראליות הקיפו את הספינה, אף נסוגו לאחק זמן קצר. על הסיפון נשמעה אזעקה, וחברי הצוות לבשו חגורות הצלה.
אחד המשתתפים כתב: "נותן עדכון, זו כנראה הייתה אזעקת שווא, היינו מוקפים בהרבה אורות בבת אחת, הקיפו אותנו, יכול להיות ספינות של כוחות הדיכוי הדיכוי הישראליים, אבל אם זה המקרה הם עזבו".
משתתפי המשט | רשתות חברתיות
פרנצ׳יסקה אלבנזה, הדווחית של האו״ם ודמות אנטי ישראלית בולטת, כתבה קודם לכן כי "אני עם המשט על הקו, התקרבו אליהם ספינות מנוע ישראליות – 5 כלי שייט מקיפים את המשט. הקפטן הנחה את הצוות להישאר רגועים וישובים עם הדרכונים וחליפות הצלה עליהם. אני שומעת אותם מדברים עם החיילים בזמן שאני כותבת… הם אומרים להם שהם נושאים סיוע הומניטרי, בנתיים הם רק מקיפים אותם. אני איתם, מקליטה הכל".
לפי ההיערכות, רשות האוכלוסין והמעברים תיקח אחריות על השלב האזרחי – ותדאג להעלות את 12 הפעילים על טיסה מחוץ לישראל. תפקיד צה"ל הוא להשתלט על כלי השיט באופן מבוקר ולנתב אותו בבטחה לחופי ישראל, בהתאם לנהלים.
מוקדם יותר הבהיר שר הביטחון ישראל כ"ץ כי הנחה את צה"ל למנוע את הגעת הספינה לעזה: "לגרטה האנטישמית ולחבריה אני אומר בצורה ברורה – תעשו אחורה פנה, כי לעזה לא תגיעו". לדבריו, מדינת ישראל לא תאפשר לאיש להפר את הסגר הימי: "ננקוט בכל אמצעי שיידרש כדי למנוע זאת".

