לאחר זיהוי החטוף החלל עודד ליפשיץ הודיע צה"ל כי גם אריאל וכפיר ביבס זוהו – אך לא אימם שירי. "זו הפרה חמורה של ההסכם", הדגיש דובר צה"ל. "אנחנו דורשים מחמאס להשיב הביתה את שירי וכל חטופינו". לפי ההערכות, האחים נרצחו במהלך העסקה הראשונה או מעט אחריה: "לפי מודיעין מוצק, לא רק הבדיקה הפתולוגית"